Koronavirüs varyantlarının artan bulaşıcılığı açıklandı

0
41

Spike RBD ve ACE2 varyantları bu çalışmada analiz edildi. (A) Bu çalışmada araştırılan RBD mutasyonlarını içeren dalları gösteren filogenetik ağaç. GISAID veri tabanından (Shu ve McCauley, 2017) SARS-CoV-2 dizilerinin Nextstrain Global (Hadfield ve diğerleri, 2018) örneğinden TreeTime (Sagulenko ve diğerleri, 2018) kullanılarak oluşturulmuştur (erişim 15 Nisan 2021, N = 4017). (B) Kutulu RBD mutantları ile SARS-CoV-2 varyantları arasında farklılık gösteren Spike kalıntılarını gösteren hizalama. Varyantlar, ilgili olduğunda Nextstrain (Hadfield ve diğerleri, 2018) ve/veya PANGO soyundan (Rambaut ve diğerleri, 2020) klan atamalarıyla etiketlenir. RBD mutasyonları, CoVariant’lardan (Hodcroft, 2021) ve Nextstrain’den derlenmiştir. (C) SARS-CoV-2 Spike RBD (camgöbeği) ile kompleks halinde insan ACE2’sinin (yeşil) yapısı. Kutunun çevrelediği alan sağda büyütülmüş olarak gösterilmiştir ve bu çalışmada mutasyona uğramış kalıntılar etiketlenmiştir. UCSF Chimera (Pettersen ve diğerleri, 2004) kullanılarak, PDB 6m0j’den (Lan ve diğerleri, 2020) koordinatlar kullanılarak çizilmiştir. Kredi: DOI: 10.7554/eLife.70658

Oxford ve Dundee Üniversitelerinden araştırmacılar, virüsteki varyasyonların neden COVID-19’un bu kadar hızlı yayılmasına neden olduğunu açıklamaya yardımcı olan bir keşif yaptılar.

Coronavirüsler, yüzeylerinde taç gibi görünmesini sağlayan sivri uçlar nedeniyle bu şekilde adlandırılmıştır; Latince kelimesi koronadır. Virüs bu sivri uçları hücrelere bağlanmak ve hücrelere girmek için kullanır ve burada çoğalırlar. Tüm yaygın SARS-CoV-2 varyantları, hücrelere bağlanan spike proteinlerinin bir kısmında mutasyonlara sahiptir.

Oxford-Dundee ekibi, sivri uçlardaki yaygın mutasyonların hepsinin olmasa da çoğunun, hücrelerimizin yüzeyinde bulunan bir protein olan ACE2’ye bağlanmayı ayrı ayrı güçlendirdiğini buldu.

Ayrıca, insanlarda doğal olarak bulunan ACE2 varyantlarının, virüs ile virüs arasındaki bağlanmayı güçlendirdiği gösterildi, bu da ortak ACE2 varyantlarına sahip bireylerin COVID-19 enfeksiyonuna daha duyarlı olabileceğini düşündürdü.

Oxford Üniversitesi Sir William Dunn Patoloji Okulu’ndan Profesör Anton van der Merwe şunları söyledi: “Çalışmamızın amacı, spike ve ACE2’deki mutasyonların etkileşimlerinin gücü üzerindeki kesin etkisini ölçmekti.

“Bu önemlidir, çünkü bazı SARS-CoV-2 varyantlarının neden daha hızlı yayıldığını anlamamıza yardımcı olur ve ayrıca ACE2’de mutasyonları olan bireylerin COVID-19’a daha duyarlı olup olmayacağını tahmin etmemize yardımcı olur.

“Spike mutasyonların ACE2’ye bağlanma üzerindeki kesin etkisini bilmek, SARS-CoV-2 varyantlarının neden daha hızlı yayıldığını anlamamıza yardımcı olur. Bu, bu yeni varyantlara verdiğimiz yanıt hakkında bilgi verebilir ve potansiyel olarak tehlikeli yeni varyantları geniş yayılmadan önce belirlememize yardımcı olabilir.”

Dünya pandemiden kurtulurken bile, koronavirüsün daha bulaşıcı varyantları ortaya çıktı. Alpha varyantı İngiltere ve diğer ülkelerde hızla diğer tüm varyantların yerini alırken, büyük ölçüde yerini alan Delta varyantı dünyaya yayılmaya devam ediyor. Beta ve Gama varyantları, daha önce orijinal SARS-CoV-2 virüsü ile enfekte olmuş popülasyonlarda da ortaya çıktı.

Bu, dünyanın dört bir yanındaki bilim adamlarını, onları daha bulaşıcı yapan özellikleri denemek ve anlamak için bu yeni varyantları incelemeye yönlendirdi. Bu son araştırma ayrıca, yaygın ACE2 mutasyonlarının bağlanmanın artmasına yol açtığını, ancak bunun tüm SARS-CoV-2 varyantları için geçerli olmadığını göstermiştir.

Dundee’nin Yaşam Bilimleri Okulu’ndan Profesör Geoff Barton şunları söyledi: “Bu sonuçlar, önde gelen deneyciler ile çalışan Hesaplamalı Biyoloji uzmanları arasındaki işbirliğinin nasıl heyecan verici yeni bulgulara yol açabileceğinin harika bir örneğidir.

“Çalışma, Dundee’deki grubumuzda Dr. Stuart MacGowan tarafından insan ACE2 varyantlarının SARS-CoV-2 bağlanması üzerindeki etkileri üzerine gerçekleştirilen bir hesaplamalı analizden doğdu. Bu, Oxford grubunun laboratuvardaki tamamlayıcı becerilerini en önemli insan ve koronavirüs varyantları.”

Kağıt bugün eLife’da yayınlandı.

Tanımlanan SARS-CoV-2 Alfa ve Beta varyantlarındaki yapısal değişiklikler Daha fazla bilgi: Michael I Barton ve diğerleri, SARS-CoV-2 Spike RBD ve ligandındaki yaygın mutasyonların, insan ACE2 reseptörünün bağlanma afinitesi ve kinetiği üzerindeki etkileri, eLife (2021). DOI: 10.7554/eLife.70658 Dergi bilgisi: Oxford Üniversitesi tarafından sağlanan eLife

Alıntı: Açıklanan koronavirüs varyantlarının artan bulaşıcılığı (2021, 1 Ekim), 1 Ekim 2021’de https://medicalxpress.com/news/2021-10-infectiousness-coronavirus-variants.html adresinden alınmıştır.

Bu belge telif haklarına tabidir. Özel çalışma veya araştırma amaçlı herhangi bir adil işlem dışında, yazılı izin alınmadan hiçbir bölüm çoğaltılamaz. İçerik yalnızca bilgi amaçlı verilmiştir.

CEVAP VER

Lütfen yorumunuzu giriniz!
Lütfen isminizi buraya giriniz